داستان جن در مورد مردی است که با خواندن یک آگهی استخدام وارد یک انبار متروکه می‌شود و در آنجا با زنی عجیب ملاقات می‌کند که زن ماموریتی به او می‌دهد تا به ایستگاه قطار برود. مرد در بین راه با پسر بچه و دختر بچه‌ای به نام ژان و ماری برخورد می‌کند که عکسی از پدر متوفایشان دارند و اندکی وضعیتشان عجیب به نظر می رسد... در بین ماجرا مرد در فضای دیگری بیدار می‌شود که به طوری گنگ خاطراتی از تجربیات قبلی خود دارد و باز دوباره در جایی دیگر و به شیوه‌های مشابهی با همین افراد ملاقات می‌کند... در یکی از این ملاقات‌ها زنی برای او توضیح می دهد که ژان دارای یک بیماری روانی است و زمان‌ها را با یکدیگر اشتباه می‌گیرد و اتفاقات آینده و گذشته را در کنار هم تجسم می‌کند و چنانچه افراد دیگری در این اتفاقات نقش داشته باشند مجبور به حضور در صحنه‌های تخیلی ژان هستند و...